經(jīng)濟效益審計與財務(wù)審計之間既有同，又有異。它們的相同之處表現(xiàn)在都是對經(jīng)濟活動的合法性、合理性和經(jīng)濟性的監(jiān)督和評價。它們的區(qū)別主要表現(xiàn)在以下幾個方面：

　　①對象不同。經(jīng)濟效益審計的對象是各種經(jīng)濟資料和有關(guān)的技術(shù)經(jīng)濟資料、經(jīng)營管理活動；而財務(wù)審計的對象僅僅是財會資料和財務(wù)收支活動。

　�、谀康牟煌�。經(jīng)濟效益審計通過審查各種經(jīng)濟資料和技術(shù)經(jīng)濟資料，評價單位的經(jīng)營管理活動是否經(jīng)濟，是否合理，是否有效益，并提出改進(jìn)意見；而財務(wù)審計則審查財會資料是否真實正確，審計財務(wù)收支是否合理合法。

　�、勐毮懿煌�。經(jīng)濟效益審計具有建設(shè)性和防護(hù)性職能，以建設(shè)性為主；而財務(wù)審計具有防護(hù)性和建設(shè)性職能，以防護(hù)性為主。

　�、芤罁�(jù)的標(biāo)準(zhǔn)不同。經(jīng)濟效益審計的標(biāo)準(zhǔn)是有關(guān)法律、財經(jīng)法規(guī)和制度，以及計劃、目標(biāo)、定額、技術(shù)經(jīng)濟指標(biāo)、同行業(yè)同類指標(biāo)；財務(wù)審計以有關(guān)法律、財經(jīng)法規(guī)和制度為標(biāo)準(zhǔn)。

　�、莘椒ú煌�。經(jīng)濟效益審計除運用財務(wù)審計方法外，還利用經(jīng)濟數(shù)學(xué)方法和現(xiàn)代管理方法，既進(jìn)行事后審計，也進(jìn)行事前審計；財務(wù)審計則通過檢查、調(diào)查和分析等方法，審查會計賬薄和財務(wù)報表，分析財務(wù)指標(biāo)，以事后審計為主。

　　由此可見，經(jīng)濟效益審計是財務(wù)審計的深入和發(fā)展。開展經(jīng)濟效益審計往往從財務(wù)審計入手，即從審查資金、成本、利潤的情況入手，然后再深入到全部經(jīng)濟活動和經(jīng)營管理中去。