員工出差過(guò)程中發(fā)生的相關(guān)費(fèi)用與差旅費(fèi)補(bǔ)助是兩個(gè)概念。員工出差過(guò)程中發(fā)生的相關(guān)費(fèi)用屬于與企業(yè)經(jīng)營(yíng)相關(guān)的費(fèi)用，如員工墊付費(fèi)用，企業(yè)可以根據(jù)實(shí)際情況報(bào)銷(xiāo)，同時(shí)根據(jù)《中華人民共和國(guó)企業(yè)所得稅法》及其實(shí)施條例的規(guī)定，企業(yè)發(fā)生的與取得收入直接相關(guān)的、符合生產(chǎn)經(jīng)營(yíng)常規(guī)的必要和正常的支出，準(zhǔn)予在計(jì)算應(yīng)納稅所得額時(shí)扣除。企業(yè)所得稅稅前扣除應(yīng)符合三個(gè)基本原則：真實(shí)性、相關(guān)性、合理性。真實(shí)性是稅前扣除的首要原則，要求納稅人提供證明支出確屬實(shí)際發(fā)生的合法、有效憑證。

    企業(yè)支付給員工的差旅費(fèi)補(bǔ)助是對(duì)員工的額外現(xiàn)金補(bǔ)助，屬于工資、薪金的一部分。關(guān)于差旅費(fèi)補(bǔ)助的標(biāo)準(zhǔn)由財(cái)政部門(mén)制定，目前對(duì)企業(yè)無(wú)具體標(biāo)準(zhǔn)，僅對(duì)中央和國(guó)家機(jī)關(guān)以及參照公務(wù)員法管理的事業(yè)單位有明確的規(guī)定，具體內(nèi)容請(qǐng)參見(jiàn)《中央和國(guó)家機(jī)關(guān)差旅費(fèi)管理辦法》（財(cái)行[2013]531號(hào)）。因此，對(duì)于行政事業(yè)單位按照財(cái)行[2013]531號(hào)文件規(guī)定的標(biāo)準(zhǔn)，發(fā)放給出差人員的差旅費(fèi)包干補(bǔ)助，可按《國(guó)家稅務(wù)總局關(guān)于印發(fā)征收個(gè)人所得稅若干問(wèn)題的規(guī)定的通知》（國(guó)稅發(fā)[1994]089號(hào)）第二條的規(guī)定，不予征收個(gè)人所得稅，超過(guò)標(biāo)準(zhǔn)的部分，應(yīng)并入職工當(dāng)月工資計(jì)征個(gè)人所得稅。