案情簡介：近期，稅務(wù)機(jī)關(guān)在對(duì)某房地產(chǎn)開發(fā)有限公司實(shí)施檢查時(shí)發(fā)現(xiàn)，該企業(yè)通過招拍掛方式取得A土地的使用權(quán)，同時(shí)，政府與該企業(yè)簽訂了補(bǔ)充協(xié)議，對(duì)企業(yè)支付的A土地的出讓金進(jìn)行財(cái)政返還。在土地增值稅清算申報(bào)時(shí)，企業(yè)根據(jù)其出讓合同約定的土地出讓金總額填報(bào)取得土地使用權(quán)所支付的金額。稅務(wù)機(jī)關(guān)認(rèn)為該企業(yè)地價(jià)款申報(bào)有誤。

稅法分析：《中華人民共和國土地增值稅暫行條例實(shí)施細(xì)則》（財(cái)法字[1995]6號(hào)）規(guī)定：取得土地使用權(quán)所支付的金額，是指納稅人為取得土地使用權(quán)所支付的地價(jià)款和按國家統(tǒng)一規(guī)定交納的有關(guān)費(fèi)用。江蘇省地方稅務(wù)局《關(guān)于土地增值稅有關(guān)業(yè)務(wù)問題的公告》（蘇地稅規(guī)[2012]1號(hào)）規(guī)定：納稅人為取得土地使用權(quán)所支付的地價(jià)款，在計(jì)算土地增值稅時(shí)，應(yīng)以納稅人實(shí)際支付土地出讓金（包括后期補(bǔ)繳的土地出讓金），減去因受讓該宗土地政府以各種形式支付給納稅人的經(jīng)濟(jì)利益后予以確認(rèn)。本案中，該企業(yè)取得土地使用權(quán)所支付的地價(jià)款應(yīng)為出讓合同約定的地價(jià)款扣除政府財(cái)政返還款后的余額，稅務(wù)機(jī)關(guān)對(duì)該企業(yè)取得土地使用權(quán)所支付的金額進(jìn)行了調(diào)整，并將審核結(jié)果書面通知企業(yè)，要求企業(yè)在規(guī)定的期限內(nèi)補(bǔ)繳稅款。