按照《國家稅務總局關于以不動產或無形資產投資入股收取固定利潤征收增值稅問題的批復》規(guī)定:"以商標權、專利權、非專利技術、著作權、商譽等投資入股,收取固定利潤的,屬于轉讓無形資產使用權的行為,應按'轉讓無形資產'稅目征收增值稅."若自然人投資入股收取固定利潤的,其應按"轉讓無形資產"繳納增值稅.該自然人屬于提供經營業(yè)務,應向A公司開具發(fā)票.

2、個人所得稅問題

《個人所得稅法實施條例》規(guī)定,特許權使用費所得,是指個人提供專利權、商標權、著作權、非專利技術以及其他特許權的使用權取得的所得.

《個人所得稅法實施條例》第十條規(guī)定,個人所得的形式,包括現(xiàn)金、實物、有價證券和其他形式的經濟利益.所得為實物的,應當按照取得的憑證上所注明的價格計算應納稅所得額;無憑證的實物或者憑證上所注明的價格明顯偏低的,參照市場價格核定應納稅所得額.所得為有價證券的,根據票面價格和市場價格核定應納稅所得額.所得為其他形式的經濟利益的,參照市場價格核定應納稅所得額.

因此,該自然人以非專利技術使用權投資入股,向A公司提供專有技術并取得A公司股權,屬于提供非專利技術使用權取得其他形式的經濟利益(A公司股權),自然人應按"特許權使用費所得"繳納個人所得稅.

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